本處轄區開放綠區可飛行、無須向本處申請，並適用「民用航空法」、「遙控無人機管理規則」及相關規定，遙控無人機操作人應遵守。除因轄區內活動辦理新增禁止飛行區域，詳見最新消息公告。
另依公益及安全之需求，本處轄管禁止以下紅區位置擅自操作遙控無人機，未經同意進入之遙控無人機，相關政府機關(構)可採取適當措施予以制止或排除，由南投縣政府進行取締；必要時，得洽警察機關協助取締。詳細公告內容請見附件檔案。
若活動需要在紅區飛行或排除操作限制等相關問題，詳見交通部民用航空局-無人機專區常見問題。
禁止無人機飛行區域：（區域範圍詳檔案：無人機禁飛區域No Drone Zone）
| 項次 | 名稱 | 座標(E,N) WGS-84(度分秒) |
有效日期起迄 |
|---|---|---|---|
| 1 | 日月潭國家風景區朝霧碼頭 | 1205455.04, 235201.09; 1205458.04, 235205.05; 1205502.09, 235202.03; 1205459.09, 235158.09; 1205455.04, 235201.09; |
109/07/01至 999/12/31 |
| 2 | 日月潭國家風景區水社碼頭 | 1205440.07, 235151.08; 1205443.01, 235153.09; 1205445.06, 235151.07; 1205443.02, 235149.04; 1205440.07, 235151.08; |
109/07/01至 999/12/31 |
| 3 | 日月潭國家風景區伊達邵碼頭 | 1205540.03, 235058.08; 1205546.05, 235102.08; 1205550.07, 235057.07; 1205544.03, 235053.06; 1205540.03, 235058.08; |
109/07/01至 999/12/31 |
| 4 | 日月潭國家風景區玄光碼頭 | 1205442.06, 235111.03; 1205448.01, 235113.00; 1205449.07, 235109.08; 1205444.02, 235108.00; 1205442.06, 235111.03; |
109/07/01至 999/12/31 |
| 5 | 日月潭國家風景區水社壩 | 1205401.04, 235143.03; 1205412.09, 235145.09; 1205413.03, 235144.09; 1205401.07, 235142.01; 1205401.04, 235143.03; |
109/07/01至 999/12/31 |
| 6 | 日月潭國家風景區向山遊客中心 | 1205405.03, 235108.07; 1205411.08, 235108.01; 1205410.08, 235101.09; 1205404.00, 235102.03; 1205405.03, 235108.07; |
109/07/01至 999/12/31 |
| 7 | 日月潭國家風景區婚紗廣場 | 1209017.08, 238535.51; 1209022.67, 238535.53; 1209022.75, 238528.92; 1209017.04, 238528.80; |
114/04/01至 999/12/31 |
其他非本處轄管區域禁止飛行，請自行洽相關單位了解詳情
| 項次 | 名稱 | 詳細公告 |
|---|---|---|
| 1 | 九族文化村 | 禁止遊客及非商業性行為狀況下使用空拍機 |
| 2 | 日月潭纜車站 | 禁止遊客及非商業性行為狀況下使用空拍機 |
| 3 | 明湖水庫出水口 | 紅區禁航區域 |
| 4 | 明潭水庫出水口 | 紅區禁航區域 |
