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日月潭生態相非常豐富,根據調查記錄發現植物計741種,以桑、樟、櫧、楠、殼斗科等等最多,蕨類植物亦非常豐富。鳥類有121種,以畫眉科、鷺科數量最多,昆蟲有鱗翅目21科260種,鞘翅目5科94種,蜻蛉目8科32種,兩棲類16種,令人目不暇給。

日月潭的昆蟲以『獨角仙』最受歡迎。從5月份開始,只要稍加注意,隨處可見獨角仙的芳蹤,尤其在夜晚時,昆蟲的趨光性使然,只要有光源的路燈下,大概都可撿到獨角仙,另外5月至9月間,在山區附近可採集到鍬形蟲,4、7、10月並可看到大型的蛇頭蛾。建議可在夜晚走一趟涵碧步道,涵碧夜色是日月潭著名的夜景之一,沿著兩公里長的步道,欣賞日月潭夜的靜謐,夏夜裡還可看見螢火蟲閃閃點點,很有詩意喔!
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